流转税的税会差异主要要来自于会计核算收入的确认原则与税法规定纳税义务发生时间、纳税义务产生等。最常见有增值税、消费税涉及的视同销售，营业税涉及的预收款纳税义务产生，增值税、营业税提前开具发票纳税义务提前，会计上由于按照准则判定不符合收入确认而税务上却须确认纳税义务等。

流转税产生的税会差异则相对简单。企业所得税由于本身比较复杂，与会计核算的资产、负债、所有者权益和损益等密切相关，所以涉及的税会差异较之就略复杂一些。