根据《财政部 税务总局关于对增值税小规模纳税人免征增值税的公告》(财政部 税务总局公告 2022 年第 15 号)规定，自 2022 年 4 月 1 日至 2022 年 12 月 31 日，小规模纳税人适用 3%征收率的应税销售收入，免征增值税;适用 3%预征率的预缴增值税项目，暂停预缴增值税。

根据《营业税改征增值税试点有关事项的规定》(财税〔2016〕36 号)附件 2 规定，小规模纳税人销售不动产适用 5%征收率，不属于适用 3%征收率的应税销售收入。

因此，贵公司销售与机构所在地不在同一县(市、区)的厂房，不适用 2022 年第 15 号公告的规定，需按现行规定在不动产所在地预缴增值税。